一、设备名称：二代基因测序仪平台
二、采购预算金额：3500000元
三、技术参数及要求
1. 二代测序平台主要内容：
1.1. 二代基因测序仪：主要用于肿瘤基因检测、药物基因筛查、基因甲基化测序、液体活检及遗传疾病筛查等临床应用，可开展全基因组测序、全外显子测序、宏基因组测序、单细胞测序等科研应用。
1.2. 自动化样本制备系统：包括组织标本和血液标本项目自动化样本制备系统。
1.3. 文库构建系统：用于肿瘤基因检测、药物基因筛查、基因甲基化测序、液体活检及遗传疾病筛查等应用的文库构建。
1.4. 生物信息分析系统：包括各类数据分析、实验室管理等方面的应用。
1.5. 其他辅助设备：满足实体肿瘤、血液肿瘤、遗传病筛查等方向的基因测序等实验过程需求的整套辅助设备。
1.6. 售后服务：协助医院搭建二代测序仪平台，向医院提供一整套平台设备及技术服务设计，共同建立医院的二代测序能力，为医院完成早期筛查、精准诊断、用药监控、疗效监测等方面的应用落地提供设备及技术支持。医院可基于此平台自主进行实体肿瘤、血液肿瘤、遗传病筛查等方向的基因测序，实现相关的临床研究及应用。
1.7. 多人阅览系统：用于肿瘤基因检测的临床诊断质控、教学。
2. 二代测序平台主要设备及主要辅助设备技术参数
2.1. 二代高通量测序仪技术参数
2.1.1. ▲有NMPA医疗器械注册证，临床注册适用范围包含NIPT、肿瘤等多种应用。
2.1.2. ▲测序技术：桥式扩增成簇，边合成边测序（SBS）。
2.1.3. ▲测序的模板扩增过程为自动化，无需手工操作，且在同一台仪器上完成，无需配置额外的设备。
2.1.4. 测序数据通量可选择两种通量的测序芯片：高通量芯片每次运行可生成≥400M条片段序列120G碱基数据；中通量芯片每次运行可生≥130M条片段序列39G碱基数据。
2.1.5. 使用双色荧光系统进行碱基识别，以提高测序速度。
2.1.6. 单张测序芯片有≥4个流道。
2.1.7. 自动化双端读取序列，读长最长为2x150个碱基。
2.1.8. 以Q30为测序质量标准（即每个碱基的准确度为99.9％），标准品Phix在2X75测序模式下，80%以上的碱基比例可达到Q30，2X150测序模式下，75%以上的碱基比例可达到Q30。
2.1.9. 可精确读取不少于12个连续单个重复碱基。
2.1.10. 测序时间需满足75循环测序时间低于12小时，300循环测序时间可低于26小时。
2.1.11. 测序通量需满足每24小时可产出不少于100Gb数据量。
2.1.12. 运行环境条件需满足温度：19℃～25℃；相对湿度：20～80%。
2.2. 自动化样本制备系统主要技术参数
自动化样本制备系统用于肿瘤基因检测、药物基因筛查、基因甲基化测序、液体活检及遗传疾病筛查前期的核酸提取（包括各类DNA、RNA提取）。可单次自动处理单个样本不造成浪费。
2.2.1. 仪器可全自动完成样品裂解、裂解液转移、核酸结合、磁珠清洗、洗脱液转移至1.5ml收集管等实验步骤的全自动操作，无需人工介入。石蜡组织可以直接自动脱蜡，提取物可用于扩增、检测及基因分析。
2.2.2. ▲样本处理量：可自由选择1-24个样本操作，不会浪费试剂条。
2.2.3. 程序运行：采用枪头移液式及枪头内吸磁法运行，枪头内做磁珠与液体分离。
2.2.4. 核酸提取得率：200μl 新鲜全血可提取6μg以上的DNA；2ml新鲜全血可提取6μg以上的RNA。
2.2.5. 核酸提取纯度：DNA A260/A280为1.7-1.9、RNA A260/A280为1.8-2.0。
2.2.6. 核酸洗脱体积可以选择30ul，60μl，100μl，150μl或200μl。
2.2.7. 安全防护：封闭式工作站，带有安全保护门，紫外灯灭菌达到分子生物学实验要求。
2.2.8. 内置加热块：室温~100℃，可进行样本的加热裂解和核酸的洗脱温育。
2.2.9. ▲处理样本：全血、动物组织、细菌、培养细胞、植物、病毒、血清血浆、无细胞体液、拭子、石蜡包埋组织、尿液等。可根据实验需求，可以选择相应样本的DNA/RNA提取试剂盒，并可以提供DNA、RNA共提试剂盒。
2.2.10. 移液精度：转移体积<100μl，误差范围≤10%；转移体积>100μl，误差范围≤4%。
2.2.11. ≥7英寸彩色触控屏幕。
2.2.12. 设备拥有24根移液头，可一次提取1-24 任意数量的样本。
2.2.13. 采用非石墨枪头。
2.2.14. 石蜡样本可以直接上机，机器自动脱蜡、裂解、解交联和提取。
2.3. 文库构建系统主要技术参数
文库构建系统完成NGS文库制备、包括核酸纯化、DNA片段长度选择、样品浓度均一化、酶反应体系构建、测序反应体系构建、磁珠纯化、温控反应、文库pooling、PCR/QPCR体系构建、分液配液等仪器设备。
2.4. 生物信息分析系统
2.4.1. ▲自动本地化完成信息分析，分析结束后直接输出检测报告，所有数据分析在本实验室完成，数据不发往公司，本地化存储、分析及管理。
2.4.2. 各生信分析系统功能可支持样品管理、实验管理、数据管理、报告管理、多种临床检测应用的信息分析、权限设置。
2.4.3. 生信分析系统具备成熟的检测相关信息分析软件。
2.4.4. 提供高性能存储和计算机工作站，满足分析需求，升级性能。硬件配置不低于：
2.4.5. 数据分析系统：储存容量：≥10000个组织（或2000个血液）样本储存数据，满足≥6年的存储容量需求。内存：≥512G；硬盘：≥300Gx2+10Tx12。
2.4.6. 报告系统：品牌工作站，CPU（i5及以上）、内存≥16G、SSD≥500G、机械硬盘≥1TB。具有二代测序中文自动分析系统，测序完自动生成分析报告，可直接打印中文版报告。
2.5. 多人阅览系统
系统适于在电源220V（±10%）/50Hz、气温5℃～40℃和最大相对湿度80%的环境条件下运行。 配置符合中国有关标准要求的插头，或提供适当的转换插座。
2.5.1. 5.1 研究级正置显微镜
2.5.1.1. 研究级正置显微镜，可作明场观察
2.5.1.2. ▲光学系统：无限远校正光学系统，齐焦距离必须为国际标准45mm
2.5.1.3. 调焦系统：载物台垂直运动方向距离不小于25mm，带聚焦粗调限位器，粗调旋钮扭矩可调，最小微调刻度单位≤1微米
2.5.1.4. 观察镜筒：宽场三目观察筒，倾角为30°
2.5.1.5. ▲ 照明装置：内置透射光柯勒照明器，高亮度LED(强度大于12V100W卤素灯)，配置加装色温调整滤光片。
2.5.1.6. 物镜：万能平场半复消色差物镜4X（N.A.0.13，W.D.17）10X（N.A.0.3，W.D.10）20X（N.A.0.5，W.D.2.1）40X（N.A.0.75，W.D.0.15）
2.5.1.7. 载物台：人机工程学、右手、低位置同轴驱动选钮的高抗磨损性陶瓷覆盖层载物台。
2.5.1.8. 目镜：10X宽视野目镜，带屈光度校准
2.5.1.9. 物镜转盘：五孔位物镜转盘
2.5.1.10. 摇摆式聚光镜：N.A.值 0.9-0.16
2.5.1.11. 十人共览光学附件
2.6. 其他辅助设备
提供满足实体肿瘤、血液肿瘤、遗传病筛查等方向的基因测序等实验过程需求的整套辅助设备，实验室不再为项目的开展而购买新的任何设备。（附录为辅助设备目录，后续根据实验室平台建设方案更新）
2.7. 售后服务：
2.7.1. 质保：承担整机系统（最终验收合格后）维护保修，使用配套试剂耗材期间承担该项目所有设备的质保，包含仪器维修维护所需要的所有耗材和配件，负责仪器的年度校准并出具校准报告，仪器故障后在2小时内响应，24小时内到达现场。
2.7.2. 提供完善的实验室技术人员培训，提供仪器安装、实验室布局及技术支持等全流程实验室解决方案。
2.7.3. 仪器使用期间，提供实体肿瘤、血液肿瘤、遗传病筛查等方向的基因测序的技术支持。
2.7.4. 技术支持团队应该具有丰富的经验，具有平台搭建，实验室管理经验。
2.7.5. 负责联接医院朗珈系统、Lis系统。并承担相关接口、工作站费用。
2.7.6. 试剂及耗材符合长沙市医保政策，需具有鑫卫网挂网价格，投标报价不得高于挂网价。
2.7.7. 检测项目试剂价格（包括试剂、耗材、质控品、校准品等项目所需所有材料。报价包括试剂及耗材，质控品、校准品等配套提供）＜每个项目收费价格（现行长沙市收费物价）的50%。
附录：
NGS平台检测实验室辅助设备清单
| 存放地点 | 序号 | 名称 | 数量 | 单位 | 要求 |
| 测序室 | 1 | 空调 | 1 | 台 | 不低于1.5匹，满足测序室温度控制 |
| 2 | 除湿机 | 1 | 台 | 用以保证实验室湿度控制 | |
| 试剂准备室 | 1 | 手动移液器 | 1 | 套 | 量程为10、100、200、1000ul |
| 2 | 纯水仪/超纯水仪 | 1 | 台 | 1. 18级纯水 2. 该系统以城市自来水为进水，连续生产III级（纯）水和I级（超）纯水 3. ▲.流速≥5L/h,辅助泵使进水稳定，排除水温或水压变化对水质的影响纯水产水水质离子截留率96-99%；有机物截流率>99%；细菌和颗粒>99%；流速：≥ 5.0L/h ；纯水电阻池常数：0.26cm－1 4. ▲超纯水产水水质：电阻率：18.2MΩ.cm ＠25℃；总有机碳含量(TOC)：＜ 5ppb；内毒素＜0.001EU／ml，细菌＜0.1cfu／ml；颗粒（＞0.22μm）＜1个／ml 5. 系统外配体积≥30L的PE水箱，圆锥形底部无死角集中式进、出水设计，可使水箱内水完全排空。 6. 密闭水箱，配空气过滤器,降低外界对水箱内水质的污染；并有卫生防溢流装置，全程液位显示,达5%精度，可根据每天用水量来控制水箱内纯水的存储量,保证水质新鲜。 7. 超纯水电阻池常数：0.019cm－1，以温度补偿及非温度补偿模式两种方式显示电阻率；超纯水可根据需要定量取水；流速：＞0.5L/min 8. 超纯水带185/254双波长紫外灯。 9. 彩色液晶显示面板，可显示出水质量（电阻率、电导率、温度），具有提醒更换纯化柱、紫外灯功能。 10. 系统符合UL标准，CE指令，ISO9001和ISO14001标准。 11. 终端精制器0.22微米，过滤细菌和颗粒 12. ▲可配置6种专用终端精制器，连续生产RNases<1pg/ml，DNases<5pg/ml的超纯水，提供官方证明材料。 13. 提供日后耗材易损件清单报价 | |
| 3 | 迷你离心机 | 1 | 台 | | |
| 4 | 超净工作台/桌面式净化工作台 | 1 | 台 | | |
| 5 | 医用冷藏冷冻冰箱 | 2 | 台 | 需保证（4℃&-20℃） | |
| 6 | PCR 低温指示冰盒 | 1 | 个 | | |
| 7 | PCR 低温指示冰盒 | 1 | 个 | | |
| 8 | 紫外消毒车 | 1 | 台 | | |
| 标本制备室 | 9 | 手动移液器 | 2 | 套 | 量程为10、100、200、1000ul |
| 10 | 核酸定量 | 1 | 台 | | |
| 11 | 迷你离心机 | 1 | 台 | | |
| 12 | 生物安全柜 | 1 | 台 | 全外排 | |
| 13 | 磁力架 | 2 | 台 | 1.5ml规格 | |
| 14 | PCR 低温指示冰盒 | 1 | 个 | | |
| 15 | PCR 低温指示冰盒 | 1 | 个 | | |
| 18 | 医用冷藏冷冻冰箱 | 1 | 台 | 需保证（4℃&-20℃） | |
| 19 | 紫外消毒车 | 1 | 台 | | |
| 文库制备室 | 20 | 手动移液器 | 1 | 套 | 量程为10、100、200、1000ul |
| 21 | 核酸定量 | 1 | 台 | | |
| 22 | 旋涡混匀仪 | 1 | 台 | | |
| 23 | 迷你离心机 | 1 | 台 | | |
| 24 | 基因扩增仪 | 2 | 台 | 满足文库制备所需，性能稳定。 | |
| 25 | PCR 低温指示冰盒 | 1 | 个 | | |
| 26 | PCR 低温指示冰盒 | 1 | 个 | | |
| 27 | 紫外消毒车 | 1 | 台 | | |
| | | 超声打断仪 | 1 | 台 | 用于基因打断 |
| 文库富集室 | 28 | 手动移液器 | 1 | 套 | 量程为10、100、200、1000ul |
| 29 | 旋涡混匀仪 | 1 | 台 | | |
| 30 | 迷你离心机 | 1 | 台 | | |
| 31 | 基因扩增仪 | 2 | 台 | 满足文库制备所需，性能稳定。 | |
| 32 | 真空浓缩仪 | 1 | 台 | | |
| 33 | 毛细管电泳仪/片段分析仪 | 1 | 台 | | |
| 34 | 核酸定量 | 1 | 台 | | |
| 35 | 磁力架 | 2 | 台 | 1.5ml规格 | |
| 36 | PCR 低温指示冰盒 | 1 | 个 | | |
| 37 | PCR 低温指示冰盒 | 1 | 个 | | |
| 38 | 医用冷藏冷冻冰箱 | 1 | 台 | 需保证（4℃&-20℃）功能 | |
| 39 | 紫外消毒车 | 1 | 台 | | |
| 测序室 | 40 | 手动移液器 | 1 | 套 | 量程为10、100、200、1000ul |
| 41 | 迷你离心机 | 1 | 台 | | |
| 42 | 旋涡混匀仪 | 1 | 台 | | |
| 43 | 医用冷藏冷冻冰箱 | 1 | 台 | 需保证（4℃&-20℃）功能 | |
| 44 | 紫外消毒车 | 1 | 台 | | |
| 机房 | 45 | 高性能储存与计算工作站 | 1 | 台 | |
| 实验室 | 47 | 显微镜 | 4 | 台 | 用途：可作普通染色切片的明场观察，用于临床诊断和科研工作。 1.1 适于在电源220V（±10%）/50Hz、气温5℃～40℃和最大相对湿度80%的环境条件下运行。 1.2 配置符合中国有关标准要求的插头，或提供适当的转换插座。 2.主要技术指标 2.1 研究级正置显微镜 2.1.1 研究级正置显微镜，可作明场观察 2.1.2 光学系统：无限远校正光学系统，齐焦距离必须为国际标准45mm 2.1.3 调焦系统：载物台垂直运动方向距离不小于25mm，带聚焦粗调限位器，粗调旋钮扭矩可调，最小微调刻度单位≤1微米 2.1.4 观察镜筒：宽场三目观察筒，倾角为30° 2.1.5 照明装置：内置透射光柯勒照明器，高亮度LED(强度大于12V100W卤素灯)，可选配加装色温调整滤光片。 2.1.6 物镜：平场消色差物镜4X（N.A. 0.1，W.D. 18.5）；10X（N.A. 0.25，W.D. 10.6）；20X（N.A. 0.4，W.D. 1.2 ）；40X（N.A. 0.65，W.D. 0.6） 2.1.7 载物台：人机工程学、右手、低位置同轴驱动选钮的高抗磨损性陶瓷覆盖层载物台。 2.1.8 目镜：10X宽视野目镜，带屈光度校准 2.1.9 物镜转盘：五孔位物镜转盘 2.1.10 摇摆式聚光镜：N.A.值 0.9-0.16 |
| 48 | 切片机+烤片 | 2 | 台 | 1切片厚度：0.5~100微米 2修片厚度：1~600微米 3样本夹头最大垂直行程：70±1毫米 4样本夹头最大水平行程：30±1毫米 5样本夹头回缩：5~100微米可调，可关闭 6夹头驱动方式：步进电机驱动 7配重方式：铅块配重，非弹簧配重 8自动注油系统 9休眠功能：机器15分钟内未操作，自动进入休眠状态 10修块模式：3种，其中必须含小手轮(非旋钮)辅助修块模式 11小手轮：机器左侧的小手轮可换向：小手轮顺时针转动夹 头前进/逆时针夹头后退，或者顺时针后退/逆时针前进 12安全锁定功能：大手轮可最高点锁定和任意位置锁定 13样品角度可调整范围：有零位显示，水平方向：±8°垂直方向：±8° 14标本钳：夹头和角度调节装置之间，有一个带燕尾滑块的 快装装置，方便从侧面快速更换或拆卸夹头 15显示：液晶显示，非电子管显示 16 搬运把手：机器后部有可折叠搬运把手，方便搬运。 | |
| 49 | 超低温冰箱 | 1 | 台 | 需保证（-80℃）功能，有效容积：≥338L，箱内温度 ：-40~ -86℃ 制冷方式：风冷 | |
| 50 | 扫码枪 | 1 | 台 | | |
| 51 | UPS电源 | 2-3 | 台 | 保证对断电仪器提供1小时以上供电。 | |
| 52 | 电脑等 | ≥3 | 台 | 品牌商用电脑，I7以上，内存≥16G，硬盘≥1T | |
| 53 | 标签打印机 | 1 | 台 | | |
| 54 | 打印机 | 1 | 台 | | |
| | 55 | 震荡仪 | 1 | 台 | |
| | 56 | 数显温湿度计 | 5 | 个 | |
| | 57 | 冷冻台式离心机 | 1 | 台 | 用于血浆分离，可用18-24样本离心 |
| | 58 | 恒温混匀仪 | 1 | 台 | 1.5-2.0ml |
| | 59 | 单槽水浴锅 | 2 | 台 | 单槽水浴锅2个或多槽多控温水浴锅1个 |
| | 60 | 实时荧光定量pcr仪 | 1 | 台 | 96通道 |
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三、技术规格：详见采购文件
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